More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2819 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  100 
 
 
159 aa  328  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  50.64 
 
 
207 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  50.65 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  47.93 
 
 
207 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  44.29 
 
 
206 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  47.5 
 
 
214 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  47.11 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  42.28 
 
 
221 aa  124  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  47.5 
 
 
207 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  47.11 
 
 
231 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
208 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  39.61 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
224 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.08 
 
 
234 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
209 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
223 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
184 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
234 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  45.3 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
221 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
234 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
218 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
218 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  43.75 
 
 
234 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  43.75 
 
 
218 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
218 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  36.99 
 
 
223 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  36.99 
 
 
224 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  36.99 
 
 
223 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.48 
 
 
221 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.99 
 
 
223 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  47.75 
 
 
424 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  36.99 
 
 
223 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  45.87 
 
 
150 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.64 
 
 
223 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  41.73 
 
 
209 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  46.77 
 
 
198 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  41.59 
 
 
170 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
333 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  46.72 
 
 
177 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
274 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.14 
 
 
217 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 
226 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  42.74 
 
 
225 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
164 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
164 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  39.6 
 
 
179 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
164 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
154 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  44.55 
 
 
222 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
156 aa  100  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  43.24 
 
 
258 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  39.44 
 
 
205 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
208 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
188 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
216 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
192 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
192 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
207 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  40.91 
 
 
228 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  43.97 
 
 
171 aa  97.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  42.42 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  40.91 
 
 
226 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  43.22 
 
 
189 aa  97.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
208 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  36.92 
 
 
248 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.31 
 
 
230 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  34.53 
 
 
283 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  34.53 
 
 
283 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  46.85 
 
 
255 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  34.9 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  40.15 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  38.28 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  39.06 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  36.15 
 
 
249 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  34.53 
 
 
283 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  41.44 
 
 
212 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  37.98 
 
 
191 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
240 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
235 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.03 
 
 
265 aa  94  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
365 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  41.67 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  40.6 
 
 
214 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.6 
 
 
214 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 
273 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
365 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 
273 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 
273 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 
273 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 
273 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.6 
 
 
212 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>