More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3121 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  100 
 
 		 333 aa  681    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  54.7 
 
 		 265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  47.18 
 
 		 150 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 150 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  53.39 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  49.18 
 
 		 232 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  52.14 
 
 		 216 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  50.42 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  51.28 
 
 		 208 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 156 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 391 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  48.74 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  50.42 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  50.42 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  44.62 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  44.83 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  48.33 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  39.43 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  49.18 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40.76 
 
 		 155 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  38.86 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  38.86 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 162 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  38.86 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  38.86 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  51.38 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 207 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  47.41 
 
 		 221 aa  112  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  50 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  48.84 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 168 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  44.26 
 
 		 193 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  45.87 
 
 		 189 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  46.4 
 
 		 154 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  44.26 
 
 		 205 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 188 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  44.27 
 
 		 154 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  44.27 
 
 		 154 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  44.27 
 
 		 154 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  44.27 
 
 		 154 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 260 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  44.27 
 
 		 154 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 154 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  45.45 
 
 		 174 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  44.7 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  47.46 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  39.07 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  39.07 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  39.07 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 235 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  44.7 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  42.75 
 
 		 154 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.96 
 
 		 183 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 210 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  43.51 
 
 		 157 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  47.15 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.5 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  47.15 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  47.15 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 164 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  47.5 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  47.5 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  47.5 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  45.61 
 
 		 458 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  47.5 
 
 		 218 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 147 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  47.5 
 
 		 218 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  47.5 
 
 		 218 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 220 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>