More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1159 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  47.65 
 
 		 341 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  45.64 
 
 		 346 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 424 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  50.83 
 
 		 342 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  50.41 
 
 		 342 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  50 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  56.88 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  45.32 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  36.97 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  41.5 
 
 		 349 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  49.07 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  42.36 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  48.18 
 
 		 347 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  40.26 
 
 		 319 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 156 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 301 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.74 
 
 		 303 aa  95.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 302 aa  94.7  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.36 
 
 		 285 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 318 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  40.98 
 
 		 309 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 341 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 289 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 167 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.87 
 
 		 255 aa  91.7  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 325 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  42.03 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  38.1 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 338 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  38.1 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  42.98 
 
 		 458 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  38.1 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  38.1 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 164 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  47.87 
 
 		 269 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 335 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  34.16 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 150 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  34.25 
 
 		 269 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 154 aa  88.6  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 476 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  39.2 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.48 
 
 		 370 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  43.9 
 
 		 171 aa  87.8  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  38.1 
 
 		 154 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 150 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.85 
 
 		 1048 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  41.46 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.48 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 168 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 450 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 154 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  37.86 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  38.99 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.02 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.48 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  37.86 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  34.1 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  40.97 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  37.86 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>