More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3043 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  64.06 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  56.2 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  56.88 
 
 		 391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  51.52 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  54.55 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.95 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  50 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  55.36 
 
 		 150 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  45.27 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  51.22 
 
 		 150 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  52.03 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  44.74 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  49.11 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  45.77 
 
 		 450 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.62 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  33.99 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  51.79 
 
 		 454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.45 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  45.38 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  48.25 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  45.97 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42.98 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  43.9 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  45.16 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  47.06 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 349 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  45.16 
 
 		 212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  45 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  45 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  45.93 
 
 		 208 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  47.24 
 
 		 173 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  45 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  49.53 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 168 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  45.76 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  48.76 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  50.41 
 
 		 193 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  43.33 
 
 		 364 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  43.33 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 424 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.38 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  50.43 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  46.15 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.19 
 
 		 170 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.6 
 
 		 370 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  47.5 
 
 		 153 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  41.61 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  45.08 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 208 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 354 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  43.33 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  43.33 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  45.13 
 
 		 169 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  42.96 
 
 		 178 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 183 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  42.5 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 154 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  41.67 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 192 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  42.5 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  42.5 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>