More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2321 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  100 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  40.47 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  39.06 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  31.92 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  32.03 
 
 		 333 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  32.03 
 
 		 333 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  31.64 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  31.64 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  31.64 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  31.64 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  45.87 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 		 333 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  31.52 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.6 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  44.04 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  31.13 
 
 		 333 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  48.6 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 333 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  27.8 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.04 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 189 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  44.92 
 
 		 208 aa  98.6  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 454 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  30.2 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 150 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 183 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  28.04 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  45.69 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  46.23 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 347 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  42.45 
 
 		 179 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  43.4 
 
 		 154 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 450 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 164 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 154 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 196 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 164 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 164 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  34.81 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.33 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 342 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  43.86 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  38.79 
 
 		 170 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 156 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 385 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 150 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.21 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 150 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  43.86 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  40.37 
 
 		 148 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  40 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 167 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  39.66 
 
 		 153 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 154 aa  86.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 175 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 188 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  43.24 
 
 		 458 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 159 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 159 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 159 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 168 aa  85.5  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 349 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  25.42 
 
 		 582 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  40.57 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.91 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  26.46 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.3 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  38.46 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  38.46 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  38.46 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>