More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2413 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  100 
 
 		 337 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  45.59 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  32.95 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  35 
 
 		 245 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  32.6 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  31.91 
 
 		 266 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  30.71 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  31.1 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  29.96 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  30.31 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  30.35 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  30.31 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  30.31 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  30.31 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  29.92 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  29.96 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.19 
 
 		 580 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  29.72 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  31.36 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 269 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.77 
 
 		 266 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.82 
 
 		 267 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 269 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  32.7 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.46 
 
 		 265 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.62 
 
 		 173 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  25.17 
 
 		 532 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 278 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 211 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  36.29 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 232 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  37.69 
 
 		 181 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  24.92 
 
 		 532 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  22.92 
 
 		 536 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  28.85 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  38.6 
 
 		 273 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  38.6 
 
 		 273 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  38.6 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  38.6 
 
 		 273 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  38.6 
 
 		 273 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  23.36 
 
 		 424 aa  86.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  36.15 
 
 		 181 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 257 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  28.2 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  27.69 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  42.02 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  40 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  29.48 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  34.25 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  27.74 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  42.02 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  35.65 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  35.65 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  32.78 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  35.65 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  32.72 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 177 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  35.57 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  35.65 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 181 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  33.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  34.18 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  35.65 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.75 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>