More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3992 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  62 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  54.27 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  54.66 
 
 		 154 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  53.37 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  53.37 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  53.37 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  52.8 
 
 		 154 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  54.27 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  54.27 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  51.55 
 
 		 154 aa  167  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  51.91 
 
 		 150 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  56.35 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  54.62 
 
 		 156 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  45.93 
 
 		 148 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  43.21 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  42.69 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  45.91 
 
 		 171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  40.72 
 
 		 189 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  55.86 
 
 		 157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  45.34 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  55.86 
 
 		 162 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  49.15 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  49.15 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  49.15 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  55.86 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  55.86 
 
 		 154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  47.37 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  51.79 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  55.86 
 
 		 154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  47.46 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  47.58 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  45.76 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 154 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  50 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  50 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  50 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  50 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  50 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  50 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  51.24 
 
 		 153 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  52.07 
 
 		 152 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  36.14 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  54.13 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.08 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 333 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  37.34 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  33.66 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  33.71 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  47.11 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  36.6 
 
 		 273 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  36.25 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  34.03 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  34.03 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  46.73 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  37.33 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  31.95 
 
 		 159 aa  99  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 274 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 246 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  34.04 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.6 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>