More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3689 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  65.15 
 
 		 196 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  54.04 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  54.66 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  54.66 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  54.04 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  54.66 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  54.66 
 
 		 154 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  52.83 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  54.48 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  54.48 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  51.15 
 
 		 150 aa  151  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  52.54 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  50.41 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  41.86 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  40.65 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  40.37 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  45.52 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  40.35 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  39.88 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  39.88 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  49.15 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  50 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  41.25 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  51.26 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  46.61 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  46.61 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  52.73 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  45.76 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  45.76 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  45.76 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  42.33 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  39.13 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  51.35 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  43.44 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  44.07 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  39.13 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  39.13 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  39.13 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  39.13 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  43.22 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  47.06 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  47.06 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  47.06 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  47.06 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  47.06 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  47.06 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  36.42 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  37.42 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  46.22 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  53.21 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  40 
 
 		 171 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  45.67 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.52 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 333 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  38.82 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  39.73 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  31.79 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.94 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  44.88 
 
 		 152 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  31.89 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.15 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 246 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 274 aa  98.6  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  44.54 
 
 		 153 aa  98.6  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  37.2 
 
 		 173 aa  97.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  31.02 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.14 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 283 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 223 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  45.45 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.14 
 
 		 228 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.82 
 
 		 234 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>