More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2565 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 190 aa  396  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 190 aa  396  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 190 aa  396  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  90 
 
 		 189 aa  358  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  99.32 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  99.32 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  73.3 
 
 		 191 aa  300  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  69.31 
 
 		 194 aa  294  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  67.72 
 
 		 193 aa  288  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  68.09 
 
 		 194 aa  281  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  68.09 
 
 		 194 aa  281  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  66.31 
 
 		 191 aa  267  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  70.05 
 
 		 191 aa  261  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  66.27 
 
 		 172 aa  241  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  55.83 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  44.21 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  47.83 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  40.83 
 
 		 171 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  46.38 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  46.38 
 
 		 164 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  46.38 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  46.38 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  41.76 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  47.11 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  45.77 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  52.07 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  53.28 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  52.46 
 
 		 155 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  53.72 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  51.24 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  51.24 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  51.24 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  51.24 
 
 		 143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  36.26 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  49.19 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  49.19 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  49.19 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  49.19 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  40.35 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  40.35 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  40.35 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  40.35 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  40.35 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 150 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  48.39 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  46.85 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  48.78 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  48.78 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  48.78 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  48.78 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  34.59 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  50 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  45.3 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  47.83 
 
 		 179 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  42.66 
 
 		 240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 173 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  35.23 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  33.84 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.23 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 347 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  51.38 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  33.52 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 346 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 265 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 342 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  36.81 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  41.18 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.71 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  50.46 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  46.36 
 
 		 342 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 342 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  48.67 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  34.3 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  44.55 
 
 		 341 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>