More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1279 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  100 
 
 		 150 aa  309  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  71.33 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 333 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  51.15 
 
 		 265 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  48 
 
 		 217 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  49.29 
 
 		 228 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  48.89 
 
 		 205 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  48.89 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 248 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 216 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  55.36 
 
 		 274 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  45.71 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  52.21 
 
 		 226 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.14 
 
 		 226 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45.74 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 249 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 224 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  44.96 
 
 		 218 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  44.96 
 
 		 218 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  44.96 
 
 		 218 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  44.96 
 
 		 218 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  44.96 
 
 		 234 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  44.96 
 
 		 234 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  44.96 
 
 		 234 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 391 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  48.51 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  50.77 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  45.24 
 
 		 224 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  47.76 
 
 		 198 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  36.09 
 
 		 258 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 223 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 215 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.24 
 
 		 223 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 223 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 215 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  47.5 
 
 		 169 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.19 
 
 		 221 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 232 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.55 
 
 		 223 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  43.75 
 
 		 212 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.54 
 
 		 173 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 221 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  48.74 
 
 		 450 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  43.75 
 
 		 226 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  47.11 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  47.11 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 454 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 257 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  47.5 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 188 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  47.93 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  44.85 
 
 		 225 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  47.11 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  45.67 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  43.87 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  38.15 
 
 		 207 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  43.8 
 
 		 205 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  42.54 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 476 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 298 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  50.93 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  49.12 
 
 		 214 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 183 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 177 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 285 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 207 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  49.09 
 
 		 342 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  48.18 
 
 		 341 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 365 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  46.67 
 
 		 365 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 269 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  44.63 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 342 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  44.03 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  43.38 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  45 
 
 		 210 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  42.22 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  43.38 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  46.28 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 342 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  45.67 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  43.86 
 
 		 267 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 278 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  47.83 
 
 		 303 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.54 
 
 		 235 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>