More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4708 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  48.62 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  48.62 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  48.62 
 
 		 172 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  41.89 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1884  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 174 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.715704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 154 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  47.11 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  29.47 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  44.55 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  44.55 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 147 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 147 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 194 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 154 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  42.2 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  40.71 
 
 		 154 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  40.71 
 
 		 154 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  40.71 
 
 		 154 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  40.71 
 
 		 154 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  40.71 
 
 		 154 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  40.18 
 
 		 159 aa  94.7  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.71 
 
 		 154 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  40.71 
 
 		 154 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 154 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  40.71 
 
 		 154 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 154 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  39.82 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 265 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 150 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  39.82 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.1 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 346 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  39.82 
 
 		 154 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  39.82 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 155 aa  92.8  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 167 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 164 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  43.22 
 
 		 153 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 164 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 154 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 164 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  44.55 
 
 		 152 aa  91.3  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 154 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  41.59 
 
 		 143 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  41.28 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  41.59 
 
 		 154 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  38.46 
 
 		 148 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3279  NLP/P60 protein  34.5 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  35.9 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  32.73 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 171 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  38.76 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  40 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 159 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 159 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 159 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 154 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 333 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  38.74 
 
 		 166 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  36.28 
 
 		 458 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  40 
 
 		 154 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 342 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 342 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>