More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1402 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  100 
 
 		 175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.94 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 407 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  45.62 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 407 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.67 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 407 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 407 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  40.12 
 
 		 407 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  44.8 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  40 
 
 		 404 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 382 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 418 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 230 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  51.35 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  42.95 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 353 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 354 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  37.5 
 
 		 364 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  45.11 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 369 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  47.71 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  47.71 
 
 		 226 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 363 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  38.69 
 
 		 363 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 363 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.2 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 273 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.12 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  50.91 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.12 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  38.96 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  49.14 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  46.61 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  39.13 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 324 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  44.59 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 333 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  45.76 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  44.29 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  38.16 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  46.73 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  41.43 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  40.68 
 
 		 283 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  40.68 
 
 		 283 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1510  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.98 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 283 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  37.16 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  37.76 
 
 		 341 aa  99  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.71 
 
 		 265 aa  99  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 283 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  34.84 
 
 		 283 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 356 aa  98.6  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 246 aa  98.2  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 240 aa  98.2  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 450 aa  97.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.23 
 
 		 273 aa  97.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.22 
 
 		 205 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.33 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.22 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 275 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  38.61 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.36 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.87 
 
 		 205 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 249 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  44.25 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 271 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  40.71 
 
 		 342 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 271 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 271 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  36.81 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 271 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  42.67 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  33.14 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>