More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2074 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  35.44 
 
 
298 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.94 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.01 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.57 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  52.71 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  50.68 
 
 
424 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36.58 
 
 
341 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  36.07 
 
 
217 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.06 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  30.09 
 
 
341 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.85 
 
 
319 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  37.22 
 
 
208 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
257 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  29.48 
 
 
346 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
342 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  46.1 
 
 
235 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  33.64 
 
 
208 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  27.81 
 
 
342 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.59 
 
 
342 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.78 
 
 
232 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  42.36 
 
 
210 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
333 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  31.14 
 
 
301 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  33.65 
 
 
216 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  28.82 
 
 
257 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  42.97 
 
 
181 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  41.54 
 
 
168 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
388 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  40.31 
 
 
391 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
476 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  45.04 
 
 
335 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 
318 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.04 
 
 
1048 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  28.11 
 
 
556 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  34.52 
 
 
223 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  45.6 
 
 
202 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  39.85 
 
 
170 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  34.52 
 
 
223 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  29.24 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  30.69 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  37.78 
 
 
407 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  29.67 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  38.92 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.14 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  37.78 
 
 
364 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.16 
 
 
224 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  37.78 
 
 
404 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  40.31 
 
 
532 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  38.52 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  34.32 
 
 
223 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  38.46 
 
 
365 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
532 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
363 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
365 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  28.19 
 
 
384 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  31.88 
 
 
224 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  39.39 
 
 
207 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.09 
 
 
208 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  34.91 
 
 
208 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  38.06 
 
 
458 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
353 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
407 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
407 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
407 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.25 
 
 
208 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  40 
 
 
205 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
407 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
407 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 
404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33.15 
 
 
207 aa  95.5  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  43.22 
 
 
174 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  32.39 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
178 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  38.17 
 
 
188 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  38.17 
 
 
188 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  37.88 
 
 
418 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
204 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  32.16 
 
 
221 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  37.88 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  32.07 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.69 
 
 
223 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.69 
 
 
223 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.69 
 
 
223 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  34.57 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  43.85 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  31.55 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
230 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.52 
 
 
205 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  36.31 
 
 
202 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
273 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.77 
 
 
210 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>