More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5001 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.71 
 
 		 388 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 388 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 452 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.32 
 
 		 438 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  46.02 
 
 		 400 aa  112  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  37.63 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.92 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 340 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.12 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.36 
 
 		 370 aa  104  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  44.8 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 374 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  52.13 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  56.57 
 
 		 495 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  47.37 
 
 		 340 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.45 
 
 		 332 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.59 
 
 		 321 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 398 aa  98.6  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 293 aa  98.2  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.78 
 
 		 1048 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  44 
 
 		 297 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 417 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 350 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 274 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 295 aa  94.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 347 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  44.04 
 
 		 368 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.39 
 
 		 331 aa  94.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 367 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  45.54 
 
 		 273 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  48.6 
 
 		 334 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 342 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.81 
 
 		 366 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 327 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 308 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 392 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 349 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 319 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  35.2 
 
 		 256 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 256 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  35.75 
 
 		 256 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 228 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  42.2 
 
 		 368 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47 
 
 		 280 aa  91.7  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 256 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 248 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 230 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  35.75 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  35.75 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  35.75 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 319 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.19 
 
 		 329 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  36.87 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 337 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  36.87 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  38.52 
 
 		 241 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  44.23 
 
 		 372 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 246 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 345 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 241 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 372 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 524 aa  89  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 480 aa  89  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  37.09 
 
 		 173 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  47.42 
 
 		 535 aa  88.6  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 286 aa  88.6  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 476 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  46.39 
 
 		 281 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 348 aa  88.6  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  48.86 
 
 		 373 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  39.26 
 
 		 253 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 248 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 374 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  43 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  37.32 
 
 		 475 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 265 aa  87  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  47.73 
 
 		 335 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 475 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 475 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  34.13 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.21 
 
 		 556 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.04 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 347 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.93 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  43.96 
 
 		 491 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 424 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.17 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>