More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1655 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 368 aa  728    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.95 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.96 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.75 
 
 		 318 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.18 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  53.91 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 		 199 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 280 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  48.55 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39 
 
 		 211 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  51.59 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  54.78 
 
 		 206 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  57.01 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  50.68 
 
 		 228 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  44.16 
 
 		 189 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  52.27 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 191 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 215 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  47.48 
 
 		 191 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  53.91 
 
 		 235 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  56.88 
 
 		 196 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  47.54 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  42.04 
 
 		 202 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  46.72 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  51.2 
 
 		 174 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  51.26 
 
 		 245 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  45.11 
 
 		 204 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  51.89 
 
 		 222 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  41.2 
 
 		 216 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 242 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 		 194 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  56.57 
 
 		 204 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  44.76 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  42.47 
 
 		 204 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  44.76 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  42.47 
 
 		 204 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  44.76 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  44.76 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  44.06 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 206 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  44.76 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 261 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  55.96 
 
 		 200 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  55.34 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  44.06 
 
 		 259 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  43.36 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  54.62 
 
 		 218 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  50.88 
 
 		 197 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  44.06 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  47.24 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  50 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  50 
 
 		 197 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  49.57 
 
 		 218 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  54.62 
 
 		 218 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 197 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 202 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  52.29 
 
 		 188 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 		 224 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  50.86 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 199 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 		 208 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  46.4 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  48.74 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  51.55 
 
 		 204 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  46.27 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.84 
 
 		 216 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 		 203 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  45.52 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  44.62 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  45.52 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  48.92 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.48 
 
 		 176 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 242 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  54.21 
 
 		 201 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  45.52 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  43.85 
 
 		 195 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 		 247 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.63 
 
 		 297 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  43.59 
 
 		 1048 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  44.63 
 
 		 297 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  49.6 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  47.97 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.78 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  44.03 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  46.55 
 
 		 206 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>