More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1294 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
199 aa  393  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  67.77 
 
 
206 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  59.2 
 
 
217 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  60.68 
 
 
280 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  47.7 
 
 
196 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  57.36 
 
 
217 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
191 aa  148  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  60.34 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  56.45 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  64.22 
 
 
188 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  62.96 
 
 
226 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  54.84 
 
 
239 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  54.84 
 
 
239 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  59.02 
 
 
244 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  56.2 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  54.84 
 
 
239 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  55.74 
 
 
249 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 
189 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  62.39 
 
 
247 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  56 
 
 
243 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  54.84 
 
 
299 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  57.72 
 
 
212 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  54.1 
 
 
174 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  60.83 
 
 
291 aa  141  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  58.82 
 
 
211 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  62.62 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  54.84 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  54.84 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  54.84 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  58.18 
 
 
283 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  55.65 
 
 
329 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  58.1 
 
 
235 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  53.66 
 
 
245 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  59.63 
 
 
326 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  50.72 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  50.72 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  51.54 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  63.64 
 
 
297 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  63.64 
 
 
297 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  48.41 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  61.48 
 
 
325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  56.3 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  62.63 
 
 
328 aa  130  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  54.62 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  49.28 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  62.04 
 
 
438 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  65.38 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  55.28 
 
 
194 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  56.8 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  48.85 
 
 
146 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  62.62 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  48.55 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  64.42 
 
 
245 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  54.62 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  49.62 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  56.86 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  42.52 
 
 
261 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  41.73 
 
 
261 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  49.06 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  58.47 
 
 
318 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  62.96 
 
 
202 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  41.73 
 
 
259 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  50.41 
 
 
202 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  48.11 
 
 
261 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  55.17 
 
 
368 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  41.73 
 
 
261 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  54.72 
 
 
217 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  62 
 
 
258 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  40.94 
 
 
261 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  40.94 
 
 
261 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  40.94 
 
 
261 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  61.76 
 
 
203 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  40.94 
 
 
261 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 
216 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 
238 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 
251 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  55.04 
 
 
218 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  61.17 
 
 
282 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  56.25 
 
 
196 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  52.38 
 
 
442 aa  121  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  55 
 
 
370 aa  121  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  54.24 
 
 
208 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  50.76 
 
 
199 aa  121  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  53.23 
 
 
263 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  62.86 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  59.6 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  52.52 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  49.25 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  50.86 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  56.48 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  51.61 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  57.84 
 
 
198 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  56.14 
 
 
241 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 
327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  57.98 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  52.46 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  59.6 
 
 
304 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  56.25 
 
 
202 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>