More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2022 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  100 
 
 
242 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  68.18 
 
 
270 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
327 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.27 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.83 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
216 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  46.05 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 
318 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.35 
 
 
1048 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  40.65 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.33 
 
 
391 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.42 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.9 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  33.88 
 
 
202 aa  89.4  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.96 
 
 
295 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 
372 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  48.98 
 
 
174 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46 
 
 
370 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  38.83 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.92 
 
 
162 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.35 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  44.21 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  38.84 
 
 
419 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  39.42 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  38.66 
 
 
307 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  43.69 
 
 
204 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
308 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.33 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  40.32 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
524 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  29.1 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  36.79 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  38.89 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  37.6 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  33.77 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  40.4 
 
 
346 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  33.55 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.6 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  42 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  51.47 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.78 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.12 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  36.57 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  39.18 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  37.23 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.48 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  33.1 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  31.94 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  42.42 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40.82 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  33.62 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  31.98 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
182 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.16 
 
 
293 aa  79  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  27.4 
 
 
349 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.21 
 
 
370 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
452 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  45.16 
 
 
391 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  35.56 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.89 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  42.11 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.51 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  40.78 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.51 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  40.18 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  35.48 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.27 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  41.05 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  39 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.78 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.78 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  31.94 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  32.65 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  45.12 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  38.84 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.89 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  32.28 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>