More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2144 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  100 
 
 
374 aa  718    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  58.93 
 
 
452 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.2 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  57.39 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  53.64 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  50.81 
 
 
374 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  38.69 
 
 
625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.61 
 
 
329 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  53.04 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.55 
 
 
162 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.38 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  32.13 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  51.72 
 
 
393 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  44.76 
 
 
388 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  48.62 
 
 
463 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.08 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  52.21 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  46.28 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
422 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  30.52 
 
 
348 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  46.6 
 
 
491 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  35.58 
 
 
375 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  29.83 
 
 
350 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.67 
 
 
366 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  48.7 
 
 
204 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
326 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  29.23 
 
 
340 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
453 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
392 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.8 
 
 
308 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  29.92 
 
 
333 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.55 
 
 
332 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  42.74 
 
 
459 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  46.36 
 
 
367 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.69 
 
 
366 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  43.31 
 
 
236 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  47.9 
 
 
319 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  28.84 
 
 
337 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
347 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
502 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  50.39 
 
 
231 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.31 
 
 
306 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  39.18 
 
 
517 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.45 
 
 
342 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  50.39 
 
 
302 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.01 
 
 
321 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.88 
 
 
475 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  50 
 
 
199 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
160 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  48.08 
 
 
480 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  26.04 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.61 
 
 
235 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
501 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.64 
 
 
531 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  29.96 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
180 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.74 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
315 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  31.18 
 
 
347 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
293 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  28.14 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.79 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  28.53 
 
 
371 aa  92  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  52.34 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  30.7 
 
 
363 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
230 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.4 
 
 
232 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  50.89 
 
 
190 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
495 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.47 
 
 
1048 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
177 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
524 aa  89.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  30.03 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  45.36 
 
 
333 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.78 
 
 
176 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  27.81 
 
 
378 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  29.6 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 
325 aa  89.4  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  29.6 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  45.74 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  43.69 
 
 
173 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
535 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
283 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  29.71 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  31.7 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  31.7 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  44.88 
 
 
308 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  39.02 
 
 
283 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  40.77 
 
 
177 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
335 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  32.53 
 
 
348 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>