More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4629 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  100 
 
 
411 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  42.33 
 
 
216 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.3 
 
 
434 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  34.19 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  43.37 
 
 
453 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.51 
 
 
506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.37 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.17 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
308 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.94 
 
 
377 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  45.22 
 
 
275 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.86 
 
 
252 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  44.52 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  29.22 
 
 
374 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.64 
 
 
275 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.33 
 
 
815 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.29 
 
 
251 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.52 
 
 
289 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  46.75 
 
 
256 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  41.82 
 
 
252 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.11 
 
 
267 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  46.75 
 
 
256 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  41.82 
 
 
252 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  47.1 
 
 
472 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  41.82 
 
 
252 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  44.68 
 
 
475 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  44.68 
 
 
475 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  44.68 
 
 
475 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  44.29 
 
 
447 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  30.86 
 
 
302 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  45.65 
 
 
469 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  45.52 
 
 
467 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  44.93 
 
 
469 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  38.41 
 
 
411 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  44.2 
 
 
469 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  48.46 
 
 
256 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  48.46 
 
 
256 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  44.2 
 
 
469 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  38.38 
 
 
282 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  44.2 
 
 
469 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  45.86 
 
 
432 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  36.41 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  45.65 
 
 
467 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  45.65 
 
 
467 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.14 
 
 
466 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
478 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
225 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  44.93 
 
 
472 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.99 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  46.27 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  49.59 
 
 
248 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40.41 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  39.72 
 
 
625 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  48.46 
 
 
256 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  46.26 
 
 
164 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
257 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
257 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
256 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
257 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  30.72 
 
 
327 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  39.88 
 
 
242 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.14 
 
 
388 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  39.88 
 
 
242 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  35.98 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.77 
 
 
277 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  39.88 
 
 
242 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  35.98 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  35.98 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  46.92 
 
 
248 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.73 
 
 
298 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.49 
 
 
1048 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  46.56 
 
 
228 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  36.97 
 
 
241 aa  93.2  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  30.81 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  35.93 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.45 
 
 
438 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  43.26 
 
 
546 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  43.05 
 
 
230 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 
447 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.78 
 
 
425 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.69 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  32.03 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
374 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.65 
 
 
249 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  34.9 
 
 
393 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  44.12 
 
 
241 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
241 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  38.22 
 
 
182 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
221 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  47.9 
 
 
249 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  28.68 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  38.41 
 
 
487 aa  87.4  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  39.73 
 
 
370 aa  87  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.63 
 
 
421 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
204 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  46.88 
 
 
459 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>