More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0889 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  100 
 
 		 337 aa  688    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  61.64 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  47.79 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  48.44 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  54.78 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  48 
 
 		 284 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  44.12 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  47.62 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  41.62 
 
 		 272 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  32.89 
 
 		 546 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 452 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  42.19 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.37 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  37.29 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  37.29 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.22 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.68 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  48.11 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  44.35 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.68 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 501 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 180 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  44.19 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  38.58 
 
 		 275 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  48.54 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 517 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  43.2 
 
 		 203 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 491 aa  97.1  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 388 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  38.13 
 
 		 1048 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  40.6 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  38.58 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  38.58 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  40.18 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  41.73 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.41 
 
 		 235 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  33.62 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 463 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  40.6 
 
 		 203 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  38.89 
 
 		 287 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  40.6 
 
 		 192 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.97 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  40.6 
 
 		 193 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  40.6 
 
 		 194 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  40.6 
 
 		 194 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  40.6 
 
 		 194 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 422 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  40.6 
 
 		 194 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.59 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  39.85 
 
 		 200 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  37.88 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  40.37 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.79 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 162 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.51 
 
 		 210 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.91 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.01 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.45 
 
 		 531 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  38.52 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  37.86 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 160 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.73 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  46.46 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 625 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 502 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.61 
 
 		 547 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  38.68 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 458 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  38.68 
 
 		 283 aa  87  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>