78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3348 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  98.45 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  98.45 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  97.94 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  97.94 
 
 		 194 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  91.75 
 
 		 192 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  96.91 
 
 		 194 aa  363  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  96.39 
 
 		 194 aa  362  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  95.88 
 
 		 194 aa  359  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  92.78 
 
 		 194 aa  356  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  92.78 
 
 		 194 aa  352  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  91.24 
 
 		 194 aa  347  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  92.78 
 
 		 193 aa  346  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  87 
 
 		 207 aa  341  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  86 
 
 		 200 aa  339  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  86.21 
 
 		 203 aa  338  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  81.77 
 
 		 203 aa  314  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  65.43 
 
 		 261 aa  218  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  65.22 
 
 		 275 aa  216  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  56.49 
 
 		 379 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  52.27 
 
 		 349 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  52.5 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  57.69 
 
 		 305 aa  121  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  49.58 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  46.51 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 		 329 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  35.75 
 
 		 275 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  55.67 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  47.62 
 
 		 256 aa  111  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  46.62 
 
 		 312 aa  111  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  50.43 
 
 		 321 aa  111  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  49.15 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  43.36 
 
 		 287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  46.27 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  54.64 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  48.31 
 
 		 284 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  44.44 
 
 		 295 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  47.11 
 
 		 320 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  45.38 
 
 		 281 aa  104  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  42.25 
 
 		 388 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.51 
 
 		 1048 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  41.35 
 
 		 387 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  58.33 
 
 		 258 aa  98.6  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  37.5 
 
 		 383 aa  98.2  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 337 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  51.92 
 
 		 312 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  52.88 
 
 		 274 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  37.02 
 
 		 281 aa  94.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.35 
 
 		 280 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  40.94 
 
 		 514 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40.48 
 
 		 437 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40.48 
 
 		 437 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.62 
 
 		 554 aa  89.4  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  48.42 
 
 		 315 aa  89.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  32.8 
 
 		 293 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  41.28 
 
 		 360 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.24 
 
 		 547 aa  86.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  31.43 
 
 		 378 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  38.33 
 
 		 357 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  40.91 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  37.5 
 
 		 359 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  33.71 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.5 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  39.74 
 
 		 635 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.34 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  34.71 
 
 		 546 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  31.75 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  30.08 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  27.98 
 
 		 384 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.41 
 
 		 386 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  39.76 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  39.24 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4581  hypothetical protein  76.67 
 
 		 72 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484909  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>