86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4551 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  100 
 
 
357 aa  730    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  77.31 
 
 
358 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  75.63 
 
 
359 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  61.8 
 
 
360 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  34.57 
 
 
635 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  39.31 
 
 
546 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  35.16 
 
 
379 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  32.78 
 
 
283 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  37.29 
 
 
305 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.2 
 
 
329 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  38.33 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  38.33 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  39.17 
 
 
194 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  38.33 
 
 
194 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  38.33 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  38.33 
 
 
203 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  35.53 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  38.33 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  38.33 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  36.67 
 
 
203 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.71 
 
 
547 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  37.4 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  38.52 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  40.5 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  33.8 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  37.98 
 
 
275 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  40.16 
 
 
284 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  32.12 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  33.1 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  39.2 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  37.14 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  37.7 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  39.09 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  37.19 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  42.55 
 
 
301 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  36.29 
 
 
281 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  36.84 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  33.12 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  31.29 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  38.58 
 
 
178 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  36.79 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.57 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  31.29 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  33.06 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  29.11 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  32.03 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  32.8 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  29.05 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  31.45 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  28.5 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  33.1 
 
 
280 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  36.54 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  30.57 
 
 
279 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  27.18 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  38.64 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  32.23 
 
 
1048 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  33.6 
 
 
274 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  31.54 
 
 
933 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  35.11 
 
 
258 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  32.11 
 
 
512 aa  53.9  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.48 
 
 
392 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 
655 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  29.03 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  30.41 
 
 
263 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  30 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  25.44 
 
 
383 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  29.13 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  39.66 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.86 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.93 
 
 
574 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  37.88 
 
 
482 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  32.97 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.09 
 
 
619 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.09 
 
 
619 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  34.74 
 
 
562 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  33.66 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  28.83 
 
 
582 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>