62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2808 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  59.06 
 
 		 344 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  41.88 
 
 		 284 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  40.52 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  42.45 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.42 
 
 		 329 aa  81.3  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 337 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  41.28 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  33.15 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  40.37 
 
 		 312 aa  75.1  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  37.84 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  44.19 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  43.02 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  47.19 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  40.38 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  39.8 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  43.62 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  48.1 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  34.62 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  37.14 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  32.14 
 
 		 272 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  46.15 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  36.67 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  35.65 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  39.09 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  39.09 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  39.09 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  38.18 
 
 		 207 aa  62  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.16 
 
 		 1048 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  39.09 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  40 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  39.09 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  39.09 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  38.18 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  44.44 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  38.18 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  38.18 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  35.54 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  38.18 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  38.18 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  38.18 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  35.54 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  42.55 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  37.08 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  38.37 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  38.46 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  28.64 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  31.25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  33.72 
 
 		 378 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.48 
 
 		 547 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  30.71 
 
 		 282 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.78 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1743  Peptidase M23  30.77 
 
 		 646 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.46 
 
 		 392 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  34.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  40.51 
 
 		 383 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  41.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  32.67 
 
 		 547 aa  40.8  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>