More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1573 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  100 
 
 		 348 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  64.08 
 
 		 1048 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  32.53 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  33.33 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.14 
 
 		 547 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.78 
 
 		 554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  41.4 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  51.64 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  33.09 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  52.94 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  46.9 
 
 		 284 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  55.1 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  49.57 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  28.61 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  29.41 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  38.51 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  48.55 
 
 		 669 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  60 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  42.68 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.75 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  56.67 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  50.43 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  30.85 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  47.5 
 
 		 283 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  53.61 
 
 		 272 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.67 
 
 		 280 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  35.56 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  54.55 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  40.77 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  38.46 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  40.68 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  40.68 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  40.68 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  41.35 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  40.91 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  40.15 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  42.37 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  44.35 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  41.53 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  40.91 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  50 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  46.46 
 
 		 727 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  46.46 
 
 		 727 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  47.62 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  39.83 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  37.07 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  37.07 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  38.98 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  42.24 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.13 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  32.84 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  42.5 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  40.15 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30.3 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  40.52 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  35.51 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  51.14 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  44.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  40.15 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  40.15 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  42.45 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  41.59 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  45.56 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  33.73 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  51.25 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  38.35 
 
 		 203 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  43.86 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  40.17 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.66 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  37.93 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  47.5 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  38.26 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  45.83 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  35.04 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.24 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  46 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  40.52 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.72 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  41.24 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  40.35 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  31.13 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  38.14 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  36.21 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  38.94 
 
 		 590 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  37.69 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.94 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  40.35 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  27.55 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>