142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0642 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 386 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  69.6 
 
 		 392 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  65.63 
 
 		 391 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  59.12 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.63 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.37 
 
 		 722 aa  136  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.1 
 
 		 579 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.26 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.38 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.81 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.62 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  49.02 
 
 		 669 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.15 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.91 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  46.21 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  38.22 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  46.92 
 
 		 669 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  40 
 
 		 442 aa  112  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  41.86 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.46 
 
 		 495 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.22 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.85 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  52.53 
 
 		 294 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.53 
 
 		 447 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.77 
 
 		 285 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  34.47 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.13 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  38.99 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.46 
 
 		 558 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.94 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  36.88 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  36.88 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  38.13 
 
 		 447 aa  86.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  34.43 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  31.77 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  37.11 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  37.96 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.08 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  32.2 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  30.14 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.97 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.66 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  32.95 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  35.15 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  33.95 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  29.32 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  36.36 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  33.51 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  38.26 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  31.07 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  30.86 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  32.89 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  37.59 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.26 
 
 		 196 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  33.91 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  31.69 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  29.59 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  32.5 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  29 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  40 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  35.71 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  27.45 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  29.67 
 
 		 194 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  30.82 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  30.82 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  29 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  29 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  32.85 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  26.96 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  27.03 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  28.5 
 
 		 194 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  29.44 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  31.39 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  28.5 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  32.12 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.46 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  28.5 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  29.14 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  25.5 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  31.39 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  32.12 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  32.47 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.79 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  46.15 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  30.08 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  32.39 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.87 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  29.07 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  31.34 
 
 		 248 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  32.84 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.57 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30.07 
 
 		 269 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  27.39 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  26.98 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0495  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.36 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>