More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0487 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  100 
 
 
379 aa  784    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  50.13 
 
 
388 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  51.86 
 
 
387 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  52.52 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  36.1 
 
 
383 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  61.29 
 
 
200 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  59.54 
 
 
194 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  58.78 
 
 
194 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  58.78 
 
 
194 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  58.78 
 
 
203 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  58.02 
 
 
192 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  58.02 
 
 
193 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  58.02 
 
 
207 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  58.87 
 
 
203 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  57.25 
 
 
194 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  57.25 
 
 
194 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  59.35 
 
 
194 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  59.35 
 
 
194 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  59.35 
 
 
194 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.92 
 
 
547 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  57.25 
 
 
194 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  56.49 
 
 
194 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  58.54 
 
 
194 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  35.6 
 
 
378 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  57.14 
 
 
275 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.26 
 
 
329 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  54.76 
 
 
261 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.23 
 
 
554 aa  142  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  43.09 
 
 
305 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  52.34 
 
 
283 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  51.85 
 
 
275 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  34.48 
 
 
348 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  42.01 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  55.65 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  47.97 
 
 
272 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  55.74 
 
 
256 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  52.24 
 
 
320 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  53.54 
 
 
301 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  47.29 
 
 
309 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  47.45 
 
 
282 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  47.45 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  52.59 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  50.86 
 
 
287 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
337 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  49.61 
 
 
286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  40.96 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  40.2 
 
 
293 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  48.72 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  43.48 
 
 
315 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.74 
 
 
280 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  47.29 
 
 
281 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  51.38 
 
 
514 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.28 
 
 
1048 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  39.62 
 
 
824 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  52.14 
 
 
258 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  35.16 
 
 
357 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  51.52 
 
 
274 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.69 
 
 
235 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  38.1 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.6 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  35.91 
 
 
358 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35.76 
 
 
231 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  35.57 
 
 
270 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40.48 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40.48 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  43.52 
 
 
347 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  38.1 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  39.67 
 
 
590 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  39.85 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  44.09 
 
 
458 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  34.67 
 
 
284 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  42.4 
 
 
251 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  41.94 
 
 
546 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.78 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  36.99 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  44.64 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  45.37 
 
 
446 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  37.06 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  37.24 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.83 
 
 
754 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  38.52 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.21 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.91 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  39.58 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  39.58 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  39.58 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.12 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  36.99 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  41.07 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  42.5 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  36.13 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  38.66 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  36.36 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  38.28 
 
 
569 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  39.6 
 
 
268 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  34.44 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  36.88 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  37.1 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  38.1 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>