More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 
547 aa  1102    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  84.81 
 
 
554 aa  898    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  55.88 
 
 
378 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  37.54 
 
 
387 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  36.46 
 
 
383 aa  171  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  37.72 
 
 
388 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  35.29 
 
 
379 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  34.04 
 
 
349 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  44 
 
 
282 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.61 
 
 
399 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.61 
 
 
399 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  35.14 
 
 
348 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  53.33 
 
 
529 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  47.37 
 
 
523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.89 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.65 
 
 
379 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  47.58 
 
 
265 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  47.93 
 
 
347 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  50.83 
 
 
475 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  45.74 
 
 
687 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  44.88 
 
 
271 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.46 
 
 
274 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.11 
 
 
375 aa  107  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  29.49 
 
 
305 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  46.03 
 
 
455 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.44 
 
 
454 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  37.09 
 
 
275 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  46.72 
 
 
390 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  46.4 
 
 
569 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.07 
 
 
402 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.57 
 
 
411 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  41.06 
 
 
238 aa  104  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.72 
 
 
375 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  42.86 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  45.97 
 
 
319 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  44.92 
 
 
305 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  49.17 
 
 
469 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  49.17 
 
 
469 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  45 
 
 
419 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  44.92 
 
 
305 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  47.79 
 
 
271 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  44.92 
 
 
305 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.35 
 
 
229 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42.48 
 
 
379 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  41.28 
 
 
682 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.44 
 
 
453 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  48.21 
 
 
287 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  36.23 
 
 
538 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  46.9 
 
 
271 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.12 
 
 
233 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.41 
 
 
312 aa  100  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  44.78 
 
 
404 aa  101  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  38.32 
 
 
541 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  45.38 
 
 
425 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.14 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  43.66 
 
 
480 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  31.71 
 
 
379 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.14 
 
 
421 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.14 
 
 
400 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  37.43 
 
 
414 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  47.97 
 
 
400 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  38.12 
 
 
1048 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  43.8 
 
 
475 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  41.22 
 
 
290 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.28 
 
 
420 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  40.74 
 
 
430 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.36 
 
 
314 aa  100  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  44.63 
 
 
362 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.86 
 
 
377 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.86 
 
 
367 aa  100  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.04 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  33.85 
 
 
404 aa  99.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  40.15 
 
 
490 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.4 
 
 
288 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  34.67 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  44.63 
 
 
425 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  33.51 
 
 
286 aa  99.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  41.94 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  46.72 
 
 
282 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  43.33 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  44.17 
 
 
446 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  40.68 
 
 
424 aa  98.6  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.41 
 
 
392 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  41.51 
 
 
243 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.1 
 
 
372 aa  98.6  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  41.22 
 
 
431 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  40.3 
 
 
392 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  44.17 
 
 
517 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.81 
 
 
423 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40.48 
 
 
455 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  49.56 
 
 
527 aa  97.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  41.54 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  42.15 
 
 
323 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  43.41 
 
 
412 aa  97.1  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.15 
 
 
431 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  43.9 
 
 
328 aa  97.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  45.67 
 
 
238 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.46 
 
 
346 aa  97.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  43.61 
 
 
398 aa  97.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>