More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1587 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  91.59 
 
 
441 aa  787    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  100 
 
 
431 aa  867    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.26 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.26 
 
 
399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  34.42 
 
 
400 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  30.59 
 
 
377 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  28.74 
 
 
379 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  29.72 
 
 
377 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  29.49 
 
 
376 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  28.73 
 
 
379 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  30.85 
 
 
404 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  27.72 
 
 
402 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  29.64 
 
 
379 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  30.63 
 
 
375 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  29.56 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  29.37 
 
 
375 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  26.09 
 
 
374 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.36 
 
 
404 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  28.34 
 
 
432 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  54.1 
 
 
375 aa  155  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.01 
 
 
374 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  28.05 
 
 
448 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  27.03 
 
 
372 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  48.17 
 
 
282 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  29.97 
 
 
373 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.67 
 
 
309 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  50.81 
 
 
324 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.39 
 
 
469 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  53.28 
 
 
524 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.41 
 
 
274 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  23.48 
 
 
419 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.32 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  50 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  28.87 
 
 
474 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  51.24 
 
 
651 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  54.05 
 
 
490 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  51.09 
 
 
216 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.12 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.38 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  59.6 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  47.58 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  50.81 
 
 
538 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  51.3 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.82 
 
 
751 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.8 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  49.25 
 
 
448 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  47.11 
 
 
300 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  49.12 
 
 
665 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  48.8 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  52.54 
 
 
415 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  33.46 
 
 
300 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  32.34 
 
 
442 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  56.64 
 
 
328 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  51.64 
 
 
648 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  49.18 
 
 
527 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  51.33 
 
 
455 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  43.75 
 
 
429 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  29.24 
 
 
313 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  47.93 
 
 
651 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  35.29 
 
 
341 aa  125  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  28.24 
 
 
302 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  47.93 
 
 
651 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  50 
 
 
676 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  43.61 
 
 
412 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  53.57 
 
 
238 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  47.83 
 
 
695 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  49.55 
 
 
680 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.63 
 
 
314 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  47.93 
 
 
301 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  51.56 
 
 
529 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  47.58 
 
 
271 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  48.65 
 
 
681 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.68 
 
 
523 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  45.45 
 
 
301 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  52.25 
 
 
697 aa  123  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  52.25 
 
 
697 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  52.14 
 
 
656 aa  123  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  50.43 
 
 
676 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.66 
 
 
727 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  46.28 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44.72 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  50.45 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  50.45 
 
 
692 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.66 
 
 
727 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  53.98 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  48.36 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  51.35 
 
 
699 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  41.46 
 
 
265 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  50.45 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  29.64 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  51.35 
 
 
681 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  44.26 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  48.74 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  25.28 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  50 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  49.56 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  31.01 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  49.55 
 
 
687 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  47.1 
 
 
541 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  50.88 
 
 
440 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>