More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0124 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  98.94 
 
 
471 aa  969    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  100 
 
 
471 aa  976    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  63.48 
 
 
490 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  64.44 
 
 
472 aa  611  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  42.93 
 
 
447 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.41 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.69 
 
 
517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  42.01 
 
 
479 aa  296  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  41.48 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.58 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.23 
 
 
475 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.23 
 
 
473 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.23 
 
 
473 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  38.93 
 
 
503 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.11 
 
 
480 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.78 
 
 
474 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  40.22 
 
 
475 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.36 
 
 
470 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.53 
 
 
448 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.59 
 
 
490 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  36.12 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  37.75 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.27 
 
 
459 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  36.06 
 
 
475 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  37.54 
 
 
491 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.39 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.39 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.61 
 
 
438 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  37.69 
 
 
441 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.2 
 
 
513 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  36.06 
 
 
475 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.75 
 
 
466 aa  236  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.93 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.92 
 
 
468 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.92 
 
 
466 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  35.63 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.55 
 
 
491 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.63 
 
 
482 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.34 
 
 
468 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.34 
 
 
468 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.34 
 
 
468 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.59 
 
 
441 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  34.02 
 
 
462 aa  230  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  34.77 
 
 
472 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.38 
 
 
512 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.16 
 
 
498 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.16 
 
 
433 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  36.49 
 
 
429 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  34.16 
 
 
741 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.08 
 
 
353 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.5 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.4 
 
 
569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  39.38 
 
 
533 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  31.96 
 
 
423 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.96 
 
 
460 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.96 
 
 
452 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.99 
 
 
465 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.26 
 
 
436 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.15 
 
 
464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.69 
 
 
430 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  35.15 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.7 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.78 
 
 
464 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.1 
 
 
441 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.99 
 
 
464 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.09 
 
 
441 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  33.51 
 
 
457 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  32.29 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.07 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  35.01 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  31.9 
 
 
440 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  31.9 
 
 
440 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  38.3 
 
 
465 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  31.9 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  32.57 
 
 
434 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  42.34 
 
 
417 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  31.81 
 
 
431 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.81 
 
 
431 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  43.29 
 
 
462 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  31.81 
 
 
431 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  31.81 
 
 
431 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  34.12 
 
 
465 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  40.6 
 
 
460 aa  193  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  33.73 
 
 
433 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  33.73 
 
 
433 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  33.73 
 
 
433 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  34.69 
 
 
454 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  33.09 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  33.43 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  42.42 
 
 
454 aa  190  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.3 
 
 
681 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  39.06 
 
 
523 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  46.19 
 
 
676 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  42.31 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.53 
 
 
385 aa  183  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  39.91 
 
 
687 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  32.43 
 
 
438 aa  183  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  32.15 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  43.28 
 
 
435 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>