More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4726 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 498 aa  1019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  47.49 
 
 		 439 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  46.49 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  44.42 
 
 		 470 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  41.91 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  42.12 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  41.82 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  42.59 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  42.65 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  41.49 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  41.7 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  42.32 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  41.75 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  43.76 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  41.91 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  41.52 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  48.07 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  39.05 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  41.23 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  39.46 
 
 		 433 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  41.52 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  51.29 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  49.25 
 
 		 353 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.38 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  38.7 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  43.75 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.95 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.65 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.33 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  40.33 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.53 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.38 
 
 		 473 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  43.7 
 
 		 475 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.94 
 
 		 503 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  41.23 
 
 		 475 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  41.23 
 
 		 473 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  42.06 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.11 
 
 		 490 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  40.06 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  39.49 
 
 		 430 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  39.02 
 
 		 741 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.46 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.98 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.14 
 
 		 441 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.63 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.39 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.56 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  36.44 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.75 
 
 		 477 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  37.05 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.72 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.31 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.16 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  40.48 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.96 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.38 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  36.44 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  37.71 
 
 		 435 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  38.15 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.13 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.86 
 
 		 464 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.39 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  37.18 
 
 		 417 aa  214  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  33.65 
 
 		 464 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  37.12 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.11 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  37.12 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.75 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  36.39 
 
 		 523 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  34.09 
 
 		 423 aa  207  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  35.41 
 
 		 453 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.59 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  33.81 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  35.28 
 
 		 446 aa  203  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  36.63 
 
 		 443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  32.98 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  35.83 
 
 		 465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  35.78 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  33.65 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  33.15 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  34.17 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  35.49 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  35.55 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  30.52 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  35.8 
 
 		 424 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  33.98 
 
 		 550 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  33.06 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  35.93 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  34.53 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  33.82 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  30.61 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  30.61 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  30.61 
 
 		 410 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  30.33 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  31.66 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  31.53 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  29.29 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  31.53 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>