More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01618 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  100 
 
 		 441 aa  915    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  61.95 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  46.11 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  46.49 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  45.01 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  53.17 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  44.59 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  44.59 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  43.74 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  44.23 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  44.59 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  42.95 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  53.91 
 
 		 475 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  42.95 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  43.19 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  47.26 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  44.37 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  50.55 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  41.56 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  45.08 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  45.62 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  44.5 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  49.72 
 
 		 353 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  44.5 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  39.39 
 
 		 459 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  43.37 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  41.11 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  42.22 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  39.14 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  41.11 
 
 		 475 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  40.56 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.56 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  38.25 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.56 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  40.83 
 
 		 503 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  37.7 
 
 		 468 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  38.64 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  44.22 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  40.59 
 
 		 513 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.55 
 
 		 480 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.61 
 
 		 490 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  40.06 
 
 		 741 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.92 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.33 
 
 		 430 aa  243  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.69 
 
 		 471 aa  239  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  37.28 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  38.42 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.91 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.17 
 
 		 465 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.24 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  35.25 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  32.86 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  35.65 
 
 		 439 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  31.92 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.03 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.82 
 
 		 477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  33.66 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  32.63 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  36.9 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  31.46 
 
 		 431 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.76 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  31.46 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  31.46 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.53 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  36.09 
 
 		 435 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  31.82 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  32.46 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  32.52 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  33.24 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.51 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  35.19 
 
 		 417 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.06 
 
 		 430 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  30.14 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  30.14 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  30.14 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  30.14 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  32.24 
 
 		 457 aa  206  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  33.05 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  33.81 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  30.11 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  30.05 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  31.28 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  31.28 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  33.24 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.52 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  30.21 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  31.12 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  32.96 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  32.7 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  33.33 
 
 		 404 aa  194  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  30.9 
 
 		 482 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  32.94 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  30.58 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  32.95 
 
 		 410 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  35.1 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  31.97 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  31.58 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  29.59 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  32.33 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  32.33 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>