More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0299 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  100 
 
 		 490 aa  1004    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  74.95 
 
 		 472 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  63.48 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  63.26 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.71 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  43.39 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  44.5 
 
 		 472 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  46.44 
 
 		 473 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  44.63 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  46.15 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.46 
 
 		 503 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  46.15 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  45.04 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  45.33 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  42.31 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  44.32 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  39.63 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.95 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  42.12 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.58 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  38.79 
 
 		 490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  35.32 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  36.32 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  37.93 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  36.89 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  37.82 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.56 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  36.78 
 
 		 468 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  37.93 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  37.64 
 
 		 468 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  37.86 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  35.28 
 
 		 477 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  36.49 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  41.81 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  36.49 
 
 		 468 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  37.64 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  38.33 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  37.09 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  37.05 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  36.39 
 
 		 498 aa  242  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  35.04 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  36.21 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  37.85 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.78 
 
 		 462 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  36.9 
 
 		 457 aa  236  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  37.82 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  36.77 
 
 		 441 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.98 
 
 		 465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.01 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  36.21 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  38.42 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  38.42 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  39.49 
 
 		 470 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.83 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  39.06 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  39.05 
 
 		 741 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  39.67 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  35.26 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.75 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  43.11 
 
 		 457 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  36.57 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.16 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  36.01 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.03 
 
 		 429 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  40.85 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  34.68 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  41.52 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  36.34 
 
 		 441 aa  210  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  39.34 
 
 		 462 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  43.13 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  43.13 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.68 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.88 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  41.6 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.15 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  38.74 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  43.04 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  35.42 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.53 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  45.3 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.19 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  35.12 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  35.12 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  35.12 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.26 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.26 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  35.12 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  42.7 
 
 		 464 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  34.81 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  35.88 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  34.38 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  34.81 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  34.81 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.58 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  35.48 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.34 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  35.59 
 
 		 692 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  39.13 
 
 		 687 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>