More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2610 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  95.36 
 
 		 434 aa  852    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  89.38 
 
 		 433 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  89.38 
 
 		 433 aa  809    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  91.42 
 
 		 431 aa  824    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  89.15 
 
 		 433 aa  807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  89.38 
 
 		 433 aa  809    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  98.38 
 
 		 431 aa  876    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  98.38 
 
 		 431 aa  876    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  100 
 
 		 431 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  68.7 
 
 		 424 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  70.19 
 
 		 419 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  66.35 
 
 		 418 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  66.35 
 
 		 418 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  64.93 
 
 		 423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  66.41 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  61.52 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  47.78 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  48.57 
 
 		 404 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  48.62 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  45.18 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  44.7 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  44.86 
 
 		 443 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  40.74 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  39.77 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  41.94 
 
 		 470 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  36.66 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  36.66 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  38.79 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  37.99 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  36.03 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  36.87 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  41.06 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  35.24 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  35.73 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  35.83 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  35.53 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  35.83 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  35.83 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  35.83 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.66 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  38.29 
 
 		 507 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  33.41 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.67 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.83 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  32.58 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  34.24 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.73 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.73 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.07 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.46 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.18 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.15 
 
 		 468 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.49 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.41 
 
 		 512 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.93 
 
 		 475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.79 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  34.59 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.25 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.25 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.93 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.25 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  35.86 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  36.05 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  36.05 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  32.75 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  36.16 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.13 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  32.18 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  30.23 
 
 		 475 aa  203  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.45 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.76 
 
 		 460 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  33.43 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.71 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  31.9 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.81 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  33.62 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  33.23 
 
 		 477 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.72 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  31.81 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  31.55 
 
 		 471 aa  193  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.31 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.84 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.71 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  31.36 
 
 		 513 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  29.89 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.72 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.73 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.15 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  33.62 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.99 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  34.31 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.89 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  31.52 
 
 		 741 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>