More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0458 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  100 
 
 		 438 aa  886    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  45.31 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  44.19 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  42.86 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  39.23 
 
 		 472 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  38.65 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  38.12 
 
 		 503 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  39.67 
 
 		 473 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  42.71 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  39.5 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  38.67 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.23 
 
 		 517 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  38.67 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  38.29 
 
 		 474 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.47 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.81 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.25 
 
 		 464 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.88 
 
 		 475 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.24 
 
 		 459 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  36.28 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.84 
 
 		 741 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  38.12 
 
 		 490 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  43.03 
 
 		 462 aa  259  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  40.33 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  39.6 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.31 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  38.22 
 
 		 457 aa  256  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.95 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.78 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  37.7 
 
 		 453 aa  250  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  41.81 
 
 		 490 aa  249  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  37.91 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  37.91 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.88 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.19 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  37.2 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.76 
 
 		 464 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.61 
 
 		 471 aa  243  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  33.8 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  33.99 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  39.91 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  39.47 
 
 		 472 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.11 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  36.64 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.26 
 
 		 503 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  36.09 
 
 		 470 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  35.64 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  35.2 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.03 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.38 
 
 		 498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.09 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  37.02 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  40.07 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  36.34 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  41.85 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.04 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  33.25 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  30.75 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  31.23 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.72 
 
 		 466 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  37.78 
 
 		 429 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.58 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.64 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.17 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.47 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.47 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  35.47 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  34.45 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.2 
 
 		 569 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.17 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  36.52 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.06 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.06 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.06 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.36 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.52 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  33.81 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.01 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.46 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  36.64 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  32.94 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.89 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  31.11 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  33.62 
 
 		 353 aa  190  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  31.7 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  31.95 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.45 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  35.82 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  33.33 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  32.44 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  39.66 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  39.39 
 
 		 680 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  38.96 
 
 		 681 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  34.54 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  38.96 
 
 		 676 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  32.46 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  35.81 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.19 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  34.2 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  34.8 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>