More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02939 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  74.95 
 
 
490 aa  735    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  100 
 
 
472 aa  967    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  65.31 
 
 
471 aa  630  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  65.17 
 
 
471 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.87 
 
 
468 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  41.6 
 
 
447 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  43.27 
 
 
473 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.44 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  42.47 
 
 
472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.16 
 
 
517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.98 
 
 
475 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.98 
 
 
473 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  41.83 
 
 
474 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  41.53 
 
 
475 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.4 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  41.21 
 
 
480 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  36.68 
 
 
479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  40.16 
 
 
470 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  40.62 
 
 
459 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  40.48 
 
 
490 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.87 
 
 
477 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  35.6 
 
 
477 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.02 
 
 
448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  37.4 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  37.43 
 
 
470 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  34.44 
 
 
475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  37.07 
 
 
491 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.47 
 
 
438 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  35.7 
 
 
462 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.43 
 
 
491 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.6 
 
 
512 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.06 
 
 
513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.7 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.9 
 
 
741 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  35.71 
 
 
441 aa  233  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  36.11 
 
 
430 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.13 
 
 
468 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.15 
 
 
475 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.13 
 
 
466 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.13 
 
 
482 aa  230  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.28 
 
 
441 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.59 
 
 
468 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.28 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.03 
 
 
441 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.3 
 
 
468 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.3 
 
 
468 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.96 
 
 
498 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.21 
 
 
468 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.65 
 
 
470 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  34.87 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  32.62 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  34.79 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.65 
 
 
457 aa  220  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  32.17 
 
 
423 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.17 
 
 
452 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.24 
 
 
569 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.47 
 
 
465 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  30.95 
 
 
433 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  41.2 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  37.54 
 
 
533 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.13 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.83 
 
 
503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  41.43 
 
 
446 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.43 
 
 
460 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.32 
 
 
465 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  32.49 
 
 
464 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  33.06 
 
 
436 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.41 
 
 
460 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  34.9 
 
 
465 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  42.15 
 
 
462 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  36.31 
 
 
464 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.38 
 
 
523 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  33.15 
 
 
441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.48 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  35.18 
 
 
438 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  40.96 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  40.96 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.87 
 
 
437 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  43.59 
 
 
464 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  40.56 
 
 
453 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  34.72 
 
 
439 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  32.02 
 
 
434 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  33.76 
 
 
687 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  39.85 
 
 
417 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  34.93 
 
 
418 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.77 
 
 
431 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  32.51 
 
 
431 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  31.19 
 
 
491 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  34.41 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  34.41 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  33.51 
 
 
429 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  33.82 
 
 
433 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  33.95 
 
 
419 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  33.82 
 
 
433 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  41.95 
 
 
435 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  33.82 
 
 
433 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  28.41 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  33.53 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  35.29 
 
 
418 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  41.15 
 
 
692 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>