More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0770 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  100 
 
 		 533 aa  1073    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.36 
 
 		 569 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  44.17 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40 
 
 		 680 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  40.37 
 
 		 692 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  40.26 
 
 		 690 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  51.2 
 
 		 676 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  41.21 
 
 		 681 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  46.37 
 
 		 687 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  46.18 
 
 		 695 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.84 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  38.25 
 
 		 475 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  39.78 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  37.7 
 
 		 447 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  39.5 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  38.42 
 
 		 474 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  39.5 
 
 		 473 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  38.66 
 
 		 472 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  35.61 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.11 
 
 		 741 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  38.76 
 
 		 503 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  45.35 
 
 		 651 aa  247  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  38.66 
 
 		 468 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  40.75 
 
 		 651 aa  246  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  40.75 
 
 		 651 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  39.26 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  44.15 
 
 		 674 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  44.7 
 
 		 681 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  42.64 
 
 		 697 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  42.64 
 
 		 697 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  43.89 
 
 		 665 aa  233  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  38.2 
 
 		 695 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.65 
 
 		 699 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  43.01 
 
 		 648 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  36.67 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  43.46 
 
 		 676 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  40.65 
 
 		 645 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  36.22 
 
 		 646 aa  229  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  44.53 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.59 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  44.14 
 
 		 640 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  35.49 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.64 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.64 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  38.2 
 
 		 471 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.81 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  35.75 
 
 		 437 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.54 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  35.94 
 
 		 470 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.67 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.81 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  37.27 
 
 		 480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.8 
 
 		 429 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  33.6 
 
 		 683 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.41 
 
 		 513 aa  210  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.13 
 
 		 438 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  31.93 
 
 		 512 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  36.69 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  36.2 
 
 		 477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.84 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.92 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.47 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.01 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  39.58 
 
 		 465 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  37.35 
 
 		 646 aa  200  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  42.86 
 
 		 615 aa  200  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  34.58 
 
 		 429 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.98 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.3 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.49 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.33 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  33.33 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  42.74 
 
 		 621 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  32.12 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.1 
 
 		 439 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  42.65 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  35.31 
 
 		 527 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.05 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.33 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.26 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  32.94 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  35.88 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  32.94 
 
 		 468 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  32.94 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  33.33 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  32.94 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.91 
 
 		 353 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.72 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  34.97 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.75 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.78 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  40.82 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  32.68 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  37.96 
 
 		 656 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  33.61 
 
 		 524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  31.49 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.53 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.63 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  31.2 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  30 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>