More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0141 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  98.94 
 
 		 471 aa  969    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  100 
 
 		 471 aa  977    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  63.26 
 
 		 490 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  65.31 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  43.44 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.15 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.69 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  42.01 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.91 
 
 		 475 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.32 
 
 		 472 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  41.96 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  41.96 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  41.96 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  38.68 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.05 
 
 		 480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.51 
 
 		 474 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  39.95 
 
 		 475 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.1 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.8 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.35 
 
 		 490 aa  259  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  38.04 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  35.8 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.27 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  36.06 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  37.54 
 
 		 491 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.13 
 
 		 477 aa  242  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.13 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  36.27 
 
 		 466 aa  239  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.11 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.19 
 
 		 513 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  36.49 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  37.28 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  36.06 
 
 		 475 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.46 
 
 		 491 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  36.21 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  35.92 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  36.21 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.63 
 
 		 468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.65 
 
 		 503 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.63 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.63 
 
 		 468 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.15 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  34.77 
 
 		 472 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  33.07 
 
 		 512 aa  229  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.84 
 
 		 441 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.31 
 
 		 498 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.29 
 
 		 429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.88 
 
 		 741 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.08 
 
 		 353 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.17 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.14 
 
 		 569 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.98 
 
 		 470 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.81 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.96 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  31.8 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.71 
 
 		 465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.8 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  32.87 
 
 		 464 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.15 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.54 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  35.89 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.42 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.87 
 
 		 464 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.81 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.38 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.58 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 		 439 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  31.74 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  33.51 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.07 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  35.01 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  42.74 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  31.64 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  31.64 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  37.94 
 
 		 465 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  31.64 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  32.32 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  31.55 
 
 		 431 aa  193  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  42.86 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.55 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  31.55 
 
 		 431 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  31.55 
 
 		 431 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  33.43 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  33.83 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  33.43 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  33.09 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  33.43 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.73 
 
 		 681 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  33.88 
 
 		 454 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.85 
 
 		 460 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  33.14 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  33.75 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  46.64 
 
 		 676 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.67 
 
 		 523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  40.34 
 
 		 687 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  42.42 
 
 		 674 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.7 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  38.55 
 
 		 695 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  32.98 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  41.88 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>