More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2732 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  100 
 
 
440 aa  882    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  94.77 
 
 
437 aa  824    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  100 
 
 
440 aa  882    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  69.95 
 
 
429 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  42.34 
 
 
441 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  40.95 
 
 
437 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.43 
 
 
517 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  38.17 
 
 
417 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.62 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  35.04 
 
 
490 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.9 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.98 
 
 
472 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.11 
 
 
479 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.79 
 
 
475 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.79 
 
 
473 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.37 
 
 
475 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  41.1 
 
 
470 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.79 
 
 
503 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.64 
 
 
533 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.82 
 
 
474 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  34.76 
 
 
741 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.18 
 
 
523 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.13 
 
 
439 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  33.52 
 
 
475 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.07 
 
 
447 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.74 
 
 
441 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.69 
 
 
465 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  34.28 
 
 
448 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.04 
 
 
569 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.06 
 
 
438 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.33 
 
 
480 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  37.85 
 
 
513 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  35.51 
 
 
464 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  39.51 
 
 
503 aa  203  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  33.81 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  31.08 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  32.56 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  32.48 
 
 
490 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  37.83 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  33.86 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  30.92 
 
 
471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  35.24 
 
 
460 aa  196  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  36.6 
 
 
459 aa  196  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  32.01 
 
 
491 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  39.8 
 
 
454 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  39.8 
 
 
454 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  33.33 
 
 
512 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  36.47 
 
 
457 aa  193  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  35.96 
 
 
472 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  29.9 
 
 
470 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.91 
 
 
446 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.33 
 
 
468 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.98 
 
 
468 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.98 
 
 
468 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  29.49 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.29 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  30.5 
 
 
475 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.65 
 
 
468 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.92 
 
 
490 aa  190  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.98 
 
 
468 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 
462 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  34.33 
 
 
482 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  33.65 
 
 
466 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  37.77 
 
 
453 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  30.97 
 
 
475 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.98 
 
 
491 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.1 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  32.96 
 
 
457 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.5 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40.6 
 
 
680 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35 
 
 
441 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.96 
 
 
695 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  42.08 
 
 
681 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  36.09 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.04 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  41.52 
 
 
676 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  30.51 
 
 
429 aa  180  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  37.72 
 
 
464 aa  180  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  31.44 
 
 
433 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  31.86 
 
 
472 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  32.52 
 
 
648 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  39.27 
 
 
690 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  33.55 
 
 
434 aa  177  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  33.18 
 
 
665 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  31.67 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  41.52 
 
 
692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  39.83 
 
 
646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  39.41 
 
 
640 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  43.48 
 
 
645 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  32.24 
 
 
353 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  40.53 
 
 
651 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  39.75 
 
 
695 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  40.53 
 
 
651 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  40.61 
 
 
687 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  39.41 
 
 
640 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  40.53 
 
 
651 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  40.27 
 
 
676 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  32.33 
 
 
477 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>