More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2498 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  100 
 
 		 646 aa  1315    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  70.87 
 
 		 640 aa  937    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  70.4 
 
 		 640 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  53.87 
 
 		 645 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  52.61 
 
 		 651 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  64.01 
 
 		 648 aa  850    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  51.66 
 
 		 651 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  51.66 
 
 		 651 aa  631  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  41.23 
 
 		 646 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  35.37 
 
 		 681 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  34.64 
 
 		 687 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  35.36 
 
 		 695 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.16 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  35.9 
 
 		 690 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  35.81 
 
 		 680 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  35.55 
 
 		 695 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  36.55 
 
 		 676 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  35.53 
 
 		 665 aa  348  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  35.77 
 
 		 681 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  34.43 
 
 		 676 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  33.79 
 
 		 674 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  33.88 
 
 		 697 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  35.13 
 
 		 683 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  33.73 
 
 		 697 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  33.04 
 
 		 699 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  35.93 
 
 		 615 aa  289  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  32.24 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  32.54 
 
 		 621 aa  273  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  43.03 
 
 		 569 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  36.22 
 
 		 533 aa  229  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  42.21 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  41.13 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  43.9 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  39.53 
 
 		 473 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.92 
 
 		 503 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.31 
 
 		 741 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  43.41 
 
 		 577 aa  181  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.45 
 
 		 473 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.45 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.8 
 
 		 517 aa  180  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.37 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.06 
 
 		 471 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.98 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.48 
 
 		 472 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  42.57 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  39.83 
 
 		 440 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  39.83 
 
 		 440 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  39.75 
 
 		 475 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  39.83 
 
 		 437 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.07 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.51 
 
 		 474 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.07 
 
 		 475 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  39.52 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  43 
 
 		 362 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.44 
 
 		 468 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.29 
 
 		 447 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  50.62 
 
 		 287 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.93 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  38.19 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.77 
 
 		 523 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  33.88 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.71 
 
 		 459 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  35.55 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  36.07 
 
 		 429 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.34 
 
 		 312 aa  155  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  30.35 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.75 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  37.29 
 
 		 402 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.18 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  37.28 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  32.62 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.11 
 
 		 441 aa  152  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  33.59 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  32.81 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  35.1 
 
 		 353 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  29.89 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  34.15 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  34.02 
 
 		 430 aa  148  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  32.11 
 
 		 470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  37.87 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.43 
 
 		 468 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35 
 
 		 503 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.08 
 
 		 468 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.43 
 
 		 468 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.96 
 
 		 491 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.02 
 
 		 482 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.2 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.53 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  37.77 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.55 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.91 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.06 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 389 aa  144  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  33.08 
 
 		 434 aa  144  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 		 353 aa  143  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.82 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.65 
 
 		 468 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.33 
 
 		 464 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  34.15 
 
 		 466 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  33.72 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>