More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0660 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  88.03 
 
 		 692 aa  1209    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  75.53 
 
 		 680 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  77.79 
 
 		 687 aa  1059    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  79.76 
 
 		 695 aa  1093    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  77.84 
 
 		 681 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  100 
 
 		 690 aa  1398    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  79.05 
 
 		 676 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  46.8 
 
 		 683 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  44.27 
 
 		 681 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  43.92 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  44.3 
 
 		 697 aa  515  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  42.3 
 
 		 676 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  43.49 
 
 		 699 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  43.31 
 
 		 674 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.88 
 
 		 665 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40.06 
 
 		 695 aa  485  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  36.99 
 
 		 640 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  37.03 
 
 		 640 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  37.37 
 
 		 651 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  37.21 
 
 		 651 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  36 
 
 		 646 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  36.39 
 
 		 651 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  36.23 
 
 		 648 aa  355  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  35.45 
 
 		 645 aa  343  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  36.54 
 
 		 621 aa  340  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  36.02 
 
 		 656 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  36.03 
 
 		 615 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 646 aa  301  3e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  48.86 
 
 		 569 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.26 
 
 		 533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  47.62 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  40.48 
 
 		 464 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  38.61 
 
 		 577 aa  195  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  38.22 
 
 		 577 aa  194  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.46 
 
 		 517 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.48 
 
 		 468 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.96 
 
 		 474 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.76 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  41.87 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.84 
 
 		 741 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.23 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.08 
 
 		 473 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.08 
 
 		 473 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.08 
 
 		 475 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.69 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.42 
 
 		 472 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  39.42 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  38.43 
 
 		 475 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.16 
 
 		 480 aa  181  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  40.87 
 
 		 523 aa  180  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.85 
 
 		 471 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  40.33 
 
 		 472 aa  178  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  38.46 
 
 		 471 aa  177  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  39.13 
 
 		 524 aa  177  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  42.08 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  42.08 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  37.05 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.13 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  36.65 
 
 		 477 aa  175  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.63 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  56.86 
 
 		 287 aa  174  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  42.34 
 
 		 435 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.25 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  38.96 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  37.85 
 
 		 362 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.85 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.02 
 
 		 441 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  34.12 
 
 		 441 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.6 
 
 		 312 aa  161  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  27.05 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  33.46 
 
 		 380 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  35.74 
 
 		 527 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.58 
 
 		 513 aa  160  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  37.5 
 
 		 503 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  37.55 
 
 		 459 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  32.26 
 
 		 429 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  31.37 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  30.21 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  39.83 
 
 		 429 aa  157  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  37.78 
 
 		 433 aa  157  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  39.13 
 
 		 353 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.45 
 
 		 491 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  35.18 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  39.5 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.2 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  29.67 
 
 		 464 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  37.07 
 
 		 470 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.09 
 
 		 470 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  29.25 
 
 		 437 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  39.01 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.52 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.5 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.59 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  29.52 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  30.99 
 
 		 482 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  36.84 
 
 		 457 aa  152  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  30.09 
 
 		 470 aa  151  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.32 
 
 		 466 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  30.81 
 
 		 468 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>