More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3949 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  63.85 
 
 		 646 aa  843    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  66.51 
 
 		 640 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  67.14 
 
 		 640 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1316    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  50.94 
 
 		 651 aa  633  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  49.37 
 
 		 651 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  49.37 
 
 		 651 aa  619  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  50.56 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  41.44 
 
 		 646 aa  505  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.25 
 
 		 692 aa  359  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  34.74 
 
 		 665 aa  350  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.83 
 
 		 687 aa  346  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  35.45 
 
 		 680 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  33.78 
 
 		 695 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  35.54 
 
 		 690 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  34.66 
 
 		 695 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  35.75 
 
 		 681 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  32.33 
 
 		 681 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  36.5 
 
 		 676 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  32.22 
 
 		 676 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  31.29 
 
 		 674 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  45.56 
 
 		 697 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  45.56 
 
 		 699 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  45.56 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  32.5 
 
 		 615 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  33.28 
 
 		 621 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  31.21 
 
 		 656 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  42.09 
 
 		 683 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  42.7 
 
 		 569 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  43.01 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  39.13 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  40.16 
 
 		 464 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.22 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.07 
 
 		 475 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  39.12 
 
 		 473 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.52 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  30.92 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.89 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  34.42 
 
 		 440 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  34.42 
 
 		 440 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  38.59 
 
 		 472 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  31.59 
 
 		 577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  38.26 
 
 		 475 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  33.88 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  38.77 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.06 
 
 		 741 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.52 
 
 		 429 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  38.77 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  31.7 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  37.82 
 
 		 447 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  38.62 
 
 		 438 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  44.69 
 
 		 362 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  37.45 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.02 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.19 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.57 
 
 		 471 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.93 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.84 
 
 		 490 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  34.41 
 
 		 523 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  53.33 
 
 		 287 aa  153  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.73 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.71 
 
 		 513 aa  150  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  34.96 
 
 		 389 aa  150  9e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  32.31 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.44 
 
 		 353 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  26.35 
 
 		 430 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  26.84 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  26.29 
 
 		 460 aa  147  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.48 
 
 		 472 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.95 
 
 		 503 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.91 
 
 		 312 aa  144  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  35.32 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  30.24 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  32.16 
 
 		 441 aa  143  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  34.47 
 
 		 448 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  34.27 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  34.51 
 
 		 460 aa  142  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  37.72 
 
 		 446 aa  141  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  30.91 
 
 		 441 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  31.52 
 
 		 433 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  34.15 
 
 		 353 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.67 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.47 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.27 
 
 		 524 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  30.08 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  33.33 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  38.83 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.29 
 
 		 464 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  32.96 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  32.96 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  32.96 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.5 
 
 		 457 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  31.99 
 
 		 470 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  35.63 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.56 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  34.15 
 
 		 454 aa  135  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.12 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  36.92 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  34.15 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  36.48 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>