More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0419 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  62.52 
 
 		 665 aa  855    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  100 
 
 		 695 aa  1420    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.31 
 
 		 681 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  44.46 
 
 		 676 aa  528  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  43.18 
 
 		 674 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  41.91 
 
 		 697 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.16 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  41.76 
 
 		 697 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  40.92 
 
 		 676 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  41.29 
 
 		 681 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40.09 
 
 		 680 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  39.35 
 
 		 695 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  39.41 
 
 		 692 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  38.06 
 
 		 687 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  41.7 
 
 		 683 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  39.64 
 
 		 690 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  39.65 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  39.47 
 
 		 621 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  34.93 
 
 		 656 aa  364  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  36.42 
 
 		 640 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  35.68 
 
 		 640 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  34.62 
 
 		 646 aa  353  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  33.78 
 
 		 648 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  34.85 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  33.64 
 
 		 651 aa  327  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  33.64 
 
 		 651 aa  327  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  34.3 
 
 		 651 aa  325  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 646 aa  287  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  38.38 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.2 
 
 		 533 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.21 
 
 		 517 aa  200  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.82 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.84 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.14 
 
 		 513 aa  194  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  39.92 
 
 		 477 aa  193  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.04 
 
 		 468 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.22 
 
 		 490 aa  191  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  39.13 
 
 		 477 aa  190  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  41.04 
 
 		 447 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  30.99 
 
 		 470 aa  190  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  34.46 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  45.13 
 
 		 475 aa  187  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.8 
 
 		 503 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  46.63 
 
 		 480 aa  183  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.51 
 
 		 475 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.04 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  41.59 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.19 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.67 
 
 		 474 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.53 
 
 		 441 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  39.04 
 
 		 441 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.09 
 
 		 473 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.06 
 
 		 471 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  34.81 
 
 		 459 aa  180  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.1 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.02 
 
 		 741 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.2 
 
 		 475 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.2 
 
 		 473 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  32.7 
 
 		 471 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  38.46 
 
 		 430 aa  177  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  41.55 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  40.3 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  44.66 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  40.08 
 
 		 472 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  46.19 
 
 		 362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  37.66 
 
 		 577 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  37.24 
 
 		 577 aa  174  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  42.79 
 
 		 470 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.92 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  59.69 
 
 		 287 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  41.44 
 
 		 440 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  41.44 
 
 		 440 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.44 
 
 		 437 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  39.47 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  30.53 
 
 		 429 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  34.19 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  42.01 
 
 		 498 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  30.02 
 
 		 464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  29.95 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  37.11 
 
 		 527 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  41.05 
 
 		 389 aa  165  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  41.7 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  37.8 
 
 		 457 aa  163  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  32.34 
 
 		 437 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.88 
 
 		 462 aa  161  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.71 
 
 		 429 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  38.98 
 
 		 433 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.4 
 
 		 491 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  32.75 
 
 		 441 aa  157  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  36.11 
 
 		 491 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.85 
 
 		 402 aa  156  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  37.19 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  38.96 
 
 		 353 aa  156  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  30.77 
 
 		 464 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  31.56 
 
 		 466 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  32.15 
 
 		 466 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  35.14 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.93 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.72 
 
 		 460 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  34.93 
 
 		 434 aa  154  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>