More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3043 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  100 
 
 		 621 aa  1212    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  81.54 
 
 		 615 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  45.79 
 
 		 656 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  45.92 
 
 		 676 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  47.38 
 
 		 681 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  43.96 
 
 		 674 aa  465  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  42.07 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  42.07 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.1 
 
 		 699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  40.32 
 
 		 665 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40.13 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  36.59 
 
 		 687 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.03 
 
 		 692 aa  359  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  36.89 
 
 		 690 aa  353  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  35.23 
 
 		 695 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  36.96 
 
 		 676 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  35.79 
 
 		 680 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  37.62 
 
 		 683 aa  339  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  36.12 
 
 		 681 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  35.88 
 
 		 651 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  35.02 
 
 		 651 aa  296  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  34.84 
 
 		 646 aa  296  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  35.02 
 
 		 651 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  34.38 
 
 		 648 aa  286  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  35.49 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  30.31 
 
 		 646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  34.07 
 
 		 640 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  33.59 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  39.32 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  42.08 
 
 		 533 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  43.75 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.36 
 
 		 503 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  36.31 
 
 		 474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.56 
 
 		 473 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  36.2 
 
 		 475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  36.2 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.18 
 
 		 475 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  41.74 
 
 		 472 aa  183  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.86 
 
 		 490 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  33.16 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  42.15 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.15 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  32.66 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  39.04 
 
 		 464 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.71 
 
 		 472 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  43.23 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  43.23 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.72 
 
 		 517 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.28 
 
 		 524 aa  170  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  33.03 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  40.98 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  37.19 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  36.78 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  40.57 
 
 		 471 aa  165  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  57.25 
 
 		 287 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.25 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.08 
 
 		 438 aa  157  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  38.1 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.87 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  36.09 
 
 		 462 aa  155  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  40.87 
 
 		 513 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.5 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  36.05 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  39.22 
 
 		 741 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  37.9 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.41 
 
 		 503 aa  151  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  30.36 
 
 		 464 aa  151  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  39.76 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  50 
 
 		 435 aa  150  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  41.94 
 
 		 523 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.34 
 
 		 465 aa  150  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.14 
 
 		 446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  33.43 
 
 		 457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  30.65 
 
 		 459 aa  148  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.04 
 
 		 441 aa  147  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.27 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  36.48 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.71 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.34 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  35.34 
 
 		 454 aa  145  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  39.11 
 
 		 362 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  39.66 
 
 		 457 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.95 
 
 		 470 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  39.66 
 
 		 457 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.14 
 
 		 386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.78 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  41.46 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.77 
 
 		 386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  34.94 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  34.83 
 
 		 453 aa  142  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  33.88 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  33.07 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.76 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  42.14 
 
 		 386 aa  140  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.07 
 
 		 389 aa  139  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.37 
 
 		 433 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  34.62 
 
 		 464 aa  137  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  42.04 
 
 		 437 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.55 
 
 		 439 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  42.04 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>