More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3541 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  100 
 
 		 527 aa  1058    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  55.03 
 
 		 524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  48.59 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.27 
 
 		 569 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.12 
 
 		 490 aa  201  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.31 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.14 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.03 
 
 		 477 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  29.75 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.17 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  32.8 
 
 		 665 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.56 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  32.63 
 
 		 680 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  37.74 
 
 		 681 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  40.24 
 
 		 490 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  38 
 
 		 676 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.79 
 
 		 471 aa  169  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  38.78 
 
 		 676 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.44 
 
 		 471 aa  167  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  39.68 
 
 		 472 aa  166  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  36.86 
 
 		 681 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  36.1 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  30.94 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  37.11 
 
 		 695 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  36.19 
 
 		 695 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.23 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.11 
 
 		 687 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  29.68 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  29.43 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  37.3 
 
 		 674 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  29.39 
 
 		 441 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  36.22 
 
 		 651 aa  160  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  35.74 
 
 		 690 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  42.47 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  32.78 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  33.88 
 
 		 646 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  32.05 
 
 		 577 aa  156  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  31.08 
 
 		 692 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  31.78 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  30.25 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  37.96 
 
 		 697 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  37.96 
 
 		 697 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  36.05 
 
 		 621 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.42 
 
 		 480 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  37.96 
 
 		 699 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  33.72 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  29.97 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  29.97 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 		 441 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  36.47 
 
 		 651 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  36.47 
 
 		 651 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  28.24 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  30.42 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  37.3 
 
 		 615 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  34.82 
 
 		 440 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  30.37 
 
 		 503 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  28.33 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  30.81 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  27.63 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  27.63 
 
 		 433 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  27.63 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  27.63 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.61 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  34.1 
 
 		 656 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  29.32 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  29.36 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  29.78 
 
 		 741 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  53.23 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  32.97 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  28.9 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  28.9 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  28.9 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  27.65 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  28.9 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  35.32 
 
 		 648 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.55 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.24 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.85 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.84 
 
 		 312 aa  143  6e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  32.67 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  26.71 
 
 		 434 aa  143  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  29.31 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  36.47 
 
 		 475 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  35.94 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  36.47 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  28.57 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  29.49 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  34.36 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.08 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  29.87 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.67 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  35 
 
 		 640 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>