More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2738 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  100 
 
 		 524 aa  1035    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  55.03 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  54.55 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.73 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.68 
 
 		 490 aa  193  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.75 
 
 		 490 aa  192  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.05 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.61 
 
 		 533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.64 
 
 		 447 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  31.36 
 
 		 468 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  31.12 
 
 		 680 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  39.34 
 
 		 676 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  39.68 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  29.23 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  28.94 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  37.01 
 
 		 687 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  39.13 
 
 		 690 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  39.51 
 
 		 695 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.06 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  30.48 
 
 		 692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  38.11 
 
 		 681 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.54 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.46 
 
 		 312 aa  170  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  38.49 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  42.28 
 
 		 621 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.13 
 
 		 503 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.37 
 
 		 472 aa  169  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.21 
 
 		 440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.76 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.53 
 
 		 437 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.21 
 
 		 440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  39.61 
 
 		 651 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.41 
 
 		 474 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.05 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  38.43 
 
 		 651 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  38.43 
 
 		 651 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.49 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  34.58 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  40.71 
 
 		 615 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  38.26 
 
 		 676 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  32.63 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  38.19 
 
 		 646 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  32.23 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  37.35 
 
 		 681 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  32.11 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  38.7 
 
 		 665 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  39.91 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  39.91 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.71 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  33.14 
 
 		 440 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  28.41 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.21 
 
 		 465 aa  156  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  28.34 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  31.49 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  29.11 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  30.75 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  35.32 
 
 		 674 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  38.49 
 
 		 699 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  39.13 
 
 		 697 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  39.13 
 
 		 697 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  33.51 
 
 		 550 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  32.08 
 
 		 656 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  26.92 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  36.43 
 
 		 695 aa  150  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  31.99 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  36.22 
 
 		 640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.08 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  29.36 
 
 		 441 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  36.22 
 
 		 640 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  31.44 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.65 
 
 		 464 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.38 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  31.97 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  31.01 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  29.28 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  57.38 
 
 		 400 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.35 
 
 		 517 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  34.78 
 
 		 523 aa  143  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  33.98 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  28.8 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  28.07 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  54.92 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  30.98 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  29.87 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  29.94 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  33.58 
 
 		 446 aa  140  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  35.27 
 
 		 648 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 498 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  29.09 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.8 
 
 		 375 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.86 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  30.45 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  38.81 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  59.29 
 
 		 238 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  31.37 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  28.89 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  29.11 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  28.81 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  34.78 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  42.24 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>