More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0074 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  100 
 
 		 513 aa  1012    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  54.55 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  48.59 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.96 
 
 		 569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.33 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.66 
 
 		 490 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  36.17 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.71 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  30.81 
 
 		 680 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  38.57 
 
 		 692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  39.82 
 
 		 695 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.65 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  38.77 
 
 		 676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  36.9 
 
 		 690 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.08 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.36 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  37.44 
 
 		 681 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.55 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.77 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.22 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  40.87 
 
 		 621 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.71 
 
 		 475 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.34 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  34.75 
 
 		 687 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.34 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  31.87 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  31.87 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  32.25 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  40.48 
 
 		 615 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  39.91 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.13 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.03 
 
 		 475 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.86 
 
 		 459 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.87 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  37.55 
 
 		 681 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  30.52 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  30.97 
 
 		 695 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  40 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  37.35 
 
 		 676 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  57.72 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  29.28 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  56.56 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  36.2 
 
 		 437 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.33 
 
 		 440 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.33 
 
 		 440 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.29 
 
 		 312 aa  146  8.000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  29.28 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  30.35 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  35.27 
 
 		 665 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  35.48 
 
 		 517 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  32.42 
 
 		 683 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  35.69 
 
 		 674 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  37.5 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  37.55 
 
 		 699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  60.53 
 
 		 238 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  37.55 
 
 		 697 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  57.26 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  37.55 
 
 		 697 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  30.42 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  31.23 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  35.85 
 
 		 651 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.8 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  31.45 
 
 		 441 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.78 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  28.7 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  30.93 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  41.03 
 
 		 651 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  36.03 
 
 		 645 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  41.03 
 
 		 651 aa  137  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  30.93 
 
 		 386 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  52.21 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  52.21 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  36.61 
 
 		 640 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  36.61 
 
 		 640 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  53.51 
 
 		 375 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.96 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.3 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.04 
 
 		 503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  52.99 
 
 		 305 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  29.88 
 
 		 439 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  29.88 
 
 		 439 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  31.8 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  48.92 
 
 		 287 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  29.88 
 
 		 439 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.52 
 
 		 439 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  29.97 
 
 		 439 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  32.76 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.46 
 
 		 402 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.73 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  29.97 
 
 		 439 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  31.16 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  35.81 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  53.85 
 
 		 404 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  29.02 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  29.51 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.11 
 
 		 741 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  36.8 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  36.8 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>