More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3520 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  53.69 
 
 
651 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  53.69 
 
 
651 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  70.72 
 
 
646 aa  943    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  67.14 
 
 
648 aa  894    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  98.12 
 
 
640 aa  1286    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  100 
 
 
640 aa  1306    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  53.5 
 
 
651 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  53.88 
 
 
645 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  40.91 
 
 
646 aa  492  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  35.59 
 
 
690 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.32 
 
 
692 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  37.11 
 
 
676 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  34.5 
 
 
680 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  34.81 
 
 
681 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.14 
 
 
687 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  35.66 
 
 
695 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  35.68 
 
 
695 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  34.8 
 
 
681 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  34.5 
 
 
665 aa  340  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  33.04 
 
 
697 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  32.8 
 
 
697 aa  330  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  33.38 
 
 
676 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  32.16 
 
 
699 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  33.93 
 
 
683 aa  313  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  31.27 
 
 
674 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  33.23 
 
 
615 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  31.95 
 
 
656 aa  270  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  32.66 
 
 
621 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  46.58 
 
 
569 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  44.53 
 
 
533 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  42.34 
 
 
490 aa  201  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  40 
 
 
464 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.04 
 
 
475 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.04 
 
 
473 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.04 
 
 
473 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  44.39 
 
 
577 aa  179  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  40.46 
 
 
503 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  43.88 
 
 
577 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.63 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.4 
 
 
517 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  42.04 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.52 
 
 
438 aa  174  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  38.93 
 
 
475 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  41.22 
 
 
475 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  39.41 
 
 
440 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  39.41 
 
 
440 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.29 
 
 
741 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  38.98 
 
 
437 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  43.84 
 
 
362 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  37.7 
 
 
581 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.06 
 
 
471 aa  166  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  41.85 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  40.09 
 
 
429 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.6 
 
 
490 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.65 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.93 
 
 
468 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.74 
 
 
447 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  49.38 
 
 
287 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  31.83 
 
 
523 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.22 
 
 
459 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.45 
 
 
312 aa  153  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  34.54 
 
 
479 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.73 
 
 
441 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.25 
 
 
446 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  34.65 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  37.4 
 
 
457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  36.22 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.33 
 
 
448 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  36.6 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.33 
 
 
513 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  34.02 
 
 
429 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.57 
 
 
472 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  32.09 
 
 
470 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  32.96 
 
 
468 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  32.96 
 
 
468 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  31.1 
 
 
353 aa  144  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  32.96 
 
 
468 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  29.53 
 
 
470 aa  143  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  29.93 
 
 
462 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.16 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  32.58 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.48 
 
 
470 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  36.92 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  39.39 
 
 
353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.84 
 
 
491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.69 
 
 
389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.75 
 
 
464 aa  142  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.03 
 
 
433 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  34.36 
 
 
527 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.45 
 
 
464 aa  141  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  34.12 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.21 
 
 
482 aa  140  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  31.46 
 
 
466 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.33 
 
 
465 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  31.09 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  33.71 
 
 
512 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  33.74 
 
 
464 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.39 
 
 
460 aa  137  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  27.67 
 
 
430 aa  137  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  38.14 
 
 
457 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>