More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1754 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  100 
 
 		 569 aa  1167    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  46.84 
 
 		 490 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  44.36 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40.1 
 
 		 680 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  48.86 
 
 		 690 aa  282  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  52.65 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  49.81 
 
 		 692 aa  281  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  49.06 
 
 		 687 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  51.23 
 
 		 681 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  50.2 
 
 		 695 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  39.69 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  34.52 
 
 		 674 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  38.64 
 
 		 665 aa  263  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  46.97 
 
 		 697 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  46.97 
 
 		 697 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  46.59 
 
 		 699 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  34.79 
 
 		 681 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  38.02 
 
 		 695 aa  253  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  38.21 
 
 		 676 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  50 
 
 		 683 aa  250  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  38.36 
 
 		 475 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  47.18 
 
 		 651 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  45.97 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  45.97 
 
 		 651 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  34.03 
 
 		 645 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  39.22 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  37.11 
 
 		 503 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  46.58 
 
 		 640 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  46.15 
 
 		 640 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.99 
 
 		 473 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.53 
 
 		 474 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  42.7 
 
 		 648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.53 
 
 		 490 aa  233  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  38.25 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  38.25 
 
 		 473 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  43.03 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  35.58 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.54 
 
 		 741 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.91 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.64 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  39.32 
 
 		 621 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.84 
 
 		 471 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  37.64 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.29 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  32.27 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.24 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  43.43 
 
 		 615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  35.55 
 
 		 527 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  33.98 
 
 		 470 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  41.2 
 
 		 656 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  32.66 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.96 
 
 		 503 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  39.49 
 
 		 477 aa  210  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  39.13 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  34.91 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.2 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  34.02 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  34.02 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.73 
 
 		 524 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  33.51 
 
 		 437 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  33.96 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  32.89 
 
 		 459 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  27.82 
 
 		 490 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  32.99 
 
 		 457 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.1 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.6 
 
 		 441 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  38.11 
 
 		 646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.6 
 
 		 312 aa  196  8.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  31.19 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.78 
 
 		 429 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.24 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  36.34 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  31.81 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.74 
 
 		 470 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.14 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  34.27 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  33.8 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.28 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  32.37 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  40.16 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.48 
 
 		 513 aa  183  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  32.11 
 
 		 439 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  34.03 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.42 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  35.42 
 
 		 454 aa  181  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  31.08 
 
 		 491 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  36.6 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  35.29 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.56 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.8 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  38.56 
 
 		 577 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  32.51 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  37.71 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  38.14 
 
 		 577 aa  176  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.61 
 
 		 437 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  28.87 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  29.36 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  30.96 
 
 		 438 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  30.71 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>