More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1597 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  100 
 
 
435 aa  871    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  44.79 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  42.5 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  43.47 
 
 
429 aa  299  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.52 
 
 
441 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  40.82 
 
 
465 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  41.28 
 
 
439 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.98 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  39.53 
 
 
417 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  38.29 
 
 
441 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  36.29 
 
 
439 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.59 
 
 
741 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  37.71 
 
 
498 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  35.03 
 
 
475 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.34 
 
 
447 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  40.11 
 
 
457 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.66 
 
 
475 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  39.17 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.76 
 
 
517 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.2 
 
 
503 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  35.06 
 
 
491 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.77 
 
 
472 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.87 
 
 
523 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  36.09 
 
 
441 aa  217  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.91 
 
 
474 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.77 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.77 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.1 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  35.33 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  35.63 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  37.94 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.89 
 
 
473 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  40.62 
 
 
353 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  32.5 
 
 
475 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  39.1 
 
 
429 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  33.14 
 
 
475 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  45.64 
 
 
459 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  31.03 
 
 
470 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.45 
 
 
490 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  35.41 
 
 
480 aa  203  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  38.35 
 
 
433 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  32.61 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  35.61 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  32.61 
 
 
468 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  32.34 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.58 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  34.88 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  32.87 
 
 
512 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  32.41 
 
 
491 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.13 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.38 
 
 
490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  32.61 
 
 
468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  34.15 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  34.15 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  33.59 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  31.86 
 
 
466 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  31.58 
 
 
466 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  31.58 
 
 
468 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.19 
 
 
503 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.81 
 
 
569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  34.91 
 
 
513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.34 
 
 
429 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.9 
 
 
464 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  37.25 
 
 
436 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.88 
 
 
533 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  41.95 
 
 
472 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  40.84 
 
 
462 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  34.52 
 
 
680 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  32.56 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  41.34 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  38.49 
 
 
477 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  38.11 
 
 
477 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  38.19 
 
 
464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  43.28 
 
 
471 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  39.85 
 
 
454 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.43 
 
 
437 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.47 
 
 
471 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  39.85 
 
 
454 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  31.79 
 
 
410 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  30.79 
 
 
440 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.62 
 
 
457 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  34.54 
 
 
438 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  31.08 
 
 
441 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  30.41 
 
 
438 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  30.41 
 
 
438 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.26 
 
 
457 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  36.33 
 
 
681 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  34.16 
 
 
676 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  37.81 
 
 
446 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40.3 
 
 
695 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  30.73 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  34.12 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>