More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6410 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  100 
 
 		 491 aa  1018    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  63.44 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  62.12 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  42.71 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  39.95 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  42.61 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  40 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  38.78 
 
 		 453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  43.37 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  38.31 
 
 		 464 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.05 
 
 		 448 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.98 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.35 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  40 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  40.56 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  36.73 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  36.32 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.21 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  33.95 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.36 
 
 		 490 aa  230  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  32.62 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.78 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.78 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.24 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  35.09 
 
 		 475 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.74 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.52 
 
 		 475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  31.88 
 
 		 490 aa  213  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  32.33 
 
 		 477 aa  213  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.7 
 
 		 447 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.7 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.82 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  32.05 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.17 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  32.02 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  32.98 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  28.97 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  31.74 
 
 		 471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  33.42 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.35 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.28 
 
 		 470 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.03 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  33.62 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.56 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  31.97 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  30.73 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  31.28 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  31.75 
 
 		 491 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  30.53 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  30.45 
 
 		 468 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  30.69 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  30.45 
 
 		 468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  31.01 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  36.49 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  31.46 
 
 		 468 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  31.44 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.45 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.28 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  30.5 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.76 
 
 		 569 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  30.09 
 
 		 433 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  29.97 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  34.34 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  30.24 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  41.7 
 
 		 472 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  41.7 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  41.7 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  30.33 
 
 		 512 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  41.7 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  41.7 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.22 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  29.32 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  31 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.1 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.92 
 
 		 503 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.01 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  36.86 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  30.87 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.05 
 
 		 533 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  30.22 
 
 		 353 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.08 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.73 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  29.27 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.28 
 
 		 420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  27.76 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  28.91 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.87 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  33.15 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  31.96 
 
 		 437 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.4 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  32.22 
 
 		 490 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  41.28 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  35.59 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  41.28 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  30.69 
 
 		 430 aa  160  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  37.45 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  34.33 
 
 		 440 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  34.33 
 
 		 440 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.06 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  36.11 
 
 		 695 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>